این ممیزی با حضور ممیزان شرکت مهندسی آب و فاضلاب کشور در دو بخش مدیریتی و فنی آغاز شده و در آن، میزان انطباق فعالیت‌های آزمایشگاه با الزامات استاندارد 17025 ISO/IEC ، روش‌های اجرایی و قابلیت اعتماد نتایج آزمون‌ها مورد ارزیابی قرار می‌گیرد.

آزمایشگاه میکروبیولوژی آبفای نجف‌آباد که ماهانه بیش از ۲۰۰ نمونه آب آشامیدنی از چهار منطقه استان اصفهان را مورد آزمون قرار می‌دهد، مسئولیت پایش و کنترل کیفیت میکروبی و فیزیکوشیمیایی نمونه‌های آب برداشت‌شده از منابع تأمین، مخازن ذخیره و شبکه‌های توزیع آب در مناطق نجف‌آباد، مهردشت، فلاورجان و فولادشهر را بر عهده دارد.

انجام آزمون‌های میکروبی با استفاده از روش‌های PA و MPN و آزمون‌های فیزیکوشیمیایی شامل اندازه‌گیری اسیدیته (pH)، هدایت الکتریکی (EC)، کلر باقیمانده و کدورت از جمله فعالیت‌های تخصصی این مرکز است.

در فرآیند ممیزی مجدد، علاوه بر بررسی مستندات و روش‌های اجرایی، صلاحیت فنی کارکنان، وضعیت تجهیزات آزمایشگاهی و صحت و قابلیت اعتماد نتایج آزمون‌ها نیز ارزیابی می‌شود.

این ممیزی با هدف استمرار انطباق فعالیت‌های آزمایشگاه با الزامات استاندارد بین‌المللی، ارتقای کیفیت خدمات آزمایشگاهی و تقویت نظام پایش کیفیت آب آشامیدنی در مناطق تحت پوشش انجام می‌شود.